1.結構簡單，體積小，重量輕。
諧波齒輪傳動的主要構件只有三個：波發生器、柔輪、剛輪。它與傳動比相當的普通減速器比較，其零件減少50%，體積和重量均減少1/3左右或更多。
2.傳動比范圍大
單級諧波減速器傳動比可在50—300之間，優選在75—250之間；
雙級諧波減速器傳動比可在3000—60000之間；
復波諧波減速器傳動比可在200—140000之間。
3.同時嚙合的齒數多。
雙波諧波減速器同時嚙合的齒數可達30%，甚至更多些。而在普通齒輪傳動中，同時嚙合的齒數只有2—7%，對于直齒圓柱漸開線齒輪同時嚙合的齒數只有1—2對。正是由于同時嚙合齒數多這一獨特的優點，使諧波傳動的精度高，齒的承載能力大，進而實現大速比、小體積。
4.承載能力大。
諧波齒輪傳動同時嚙合齒數多，即承受載荷的齒數多，在材料和速比相同的情況下，受載能力要大大超過其它傳動。其傳遞的功率范圍可為幾瓦至幾十千瓦。
5.運動精度高。
由于多齒嚙合，一般情況下，諧波齒輪與相同精度的普通齒輪相比，其運動精度能提高四倍左右。
6.運動平穩，無沖擊，噪聲小。
齒的嚙入、嚙出是隨著柔輪的變形，逐漸進入和逐漸退出剛輪齒間的，嚙合過程中齒面接觸，滑移速度小，且無突然變化。
7.齒側間隙可以調整。
諧波齒輪傳動在嚙合中，柔輪和剛輪齒之間主要取決于波發生器外形的最大尺寸，及兩齒輪的齒形尺寸，因此可以使傳動的回差很小，某些情況甚至可以是零側間隙。
8.傳動效率高。
與相同速比的其它傳動相比，諧波傳動由于運動部件數量少，而且嚙合齒面的速度很低，因此效率很高，隨速比的不同（u=60-250)，效率約在65—96%左右（諧波復波傳動效率較低），齒面的磨損很小。
9.同軸性好。
諧波齒輪減速器的高速軸、低速軸位于同一軸線上。
10.可實現向密閉空間傳遞運動及動力。
采用密封柔輪諧波傳動減速裝置，可以驅動工作在高真空、有腐蝕性及其它有害介質空間的機構，諧波傳動這一獨特優點是其它傳動機構難于達到的。
11.可實現高增速運動。
由于諧波齒輪傳動的效率高及機構本身的特點，加之體積小、重量輕的優點，因此是理想的高增速裝置。對于手搖發電機、風力發電機等需要高增速的設備有廣闊的應用前景。
12.方便的實現差速傳動。
由于諧波齒輪傳動的三個基本構件中，可以任意兩個主動，第三個從動，那么如果讓波發生器、剛輪主動，柔輪從動，就可以構成一個差動傳動機構，從而方便的實現快慢速工作狀況。這一點對許多機床的走刀機構很有實用價值，經適當設計，可以大大改變機床走刀部分的結構性能。
13.諧波齒輪傳動與其它傳動性能的具體比較。
當輸入轉速1500轉/分鐘，傳動比和輸出力矩相同的情況下，四種普通減速器與諧波齒輪傳動減速器的性能比較為：
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